Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CbfbQ08024 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CbfbQ08024 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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