Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Col9a2Q07643 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Col9a2Q07643 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms