Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col17a1Q07563 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col17a1Q07563 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms