Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal1Q05A62 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms