Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fmn1Q05860 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fmn1Q05860 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms