Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col9a1Q05722 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms