Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdk18Q04899 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms