Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox13Q04891 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms