Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sox12Q04890 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms