Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cxcr5Q04683 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcr5Q04683 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms