Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smpd1Q04519 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smpd1Q04519 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms