Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnd1Q03719 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kcnd1Q03719 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms