Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crisp3Q03402 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms