Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msx2Q03358 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms