Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddr1Q03146 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms