Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms