Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a2Q02788 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms