Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NfiaQ02780 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms