Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nhlh1Q02576 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nhlh1Q02576 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms