Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Muc1Q02496 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Muc1Q02496 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms