Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JupQ02257 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JupQ02257 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JupQ02257 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JupQ02257 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JupQ02257 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
JupQ02257 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
JupQ02257 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
JupQ02257 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms