Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PrkcqQ02111 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms