Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ascl1Q02067 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms