Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1cQ01815 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms