Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gbp1Q01514 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms