Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top2aQ01320 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Top2aQ01320 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms