Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
EgfrQ01279 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms