Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SelpQ01102 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SelpQ01102 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SelpQ01102 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelpQ01102 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SelpQ01102 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms