Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pde1bQ01065 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms