Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rbp4Q00724 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbp4Q00724 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms