Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GabpaQ00422 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms