Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou1f1Q00286 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pou1f1Q00286 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms