Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PgrQ00175 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PgrQ00175 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms