Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SirpaP97797 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SirpaP97797 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms