Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AlkP97793 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AlkP97793 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AlkP97793 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AlkP97793 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AlkP97793 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AlkP97793 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AlkP97793 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AlkP97793 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AlkP97793 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AlkP97793 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AlkP97793 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AlkP97793 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AlkP97793 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms