Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cry1P97784 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cry1P97784 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms