Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Polr2cP97760 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Polr2cP97760 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms