Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Frg1P97376 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Frg1P97376 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms