Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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PrkdcP97313 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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PrkdcP97313 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PrkdcP97313 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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