Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccl21cP86793 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl21cP86793 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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