Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cct4P80315 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cct4P80315 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms