Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms