Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp9xP70398 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9xP70398 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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