Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shox2P70390 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Shox2P70390 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms