Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx3P70354 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms