Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tbx6P70327 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms