Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sycp3P70281 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms