Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp7P70280 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms