Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hoxd13P70217 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hoxd13P70217 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms