Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Plxna3P70208 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Plxna3P70208 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms